Обособленное подразделение (ОП), которое является филиалом или представительством, ставят на налоговый учет автоматически на основании сведений из ЕГРЮЛ (п. 3 ст. 83 НК РФ). О других ОП в ИФНС по месту нахождения организации вы должны подать сообщение по форме N С-09-3-1. На это у вас есть месяц со дня создания ОП (пп. 3 п. 2 ст. 23, п. 4 ст. 83 НК РФ). Подавать в ИФНС документы, подтверждающие создание ОП, не надо (п. 2.1 Письма ФНС от 03.09.2010 N МН-37-6/10623@). ОП ставят на учет в инспекции, соответствующей его адресу. Однако есть два исключения (п. 4 ст. 83 НК РФ, Письмо ФНС от 28.09.2011 N ПА-4-6/15886):

1) если вы создаете несколько ОП в одном городе (муниципальном районе, городском округе, Москве, Санкт-Петербурге), их все можно поставить на учет в одной ИФНС - по месту нахождения любого из ОП;

2) в инспекции, где уже числится одно из ваших обособленных подразделений, можно поставить на учет ОП, которое вы открываете в том же городе. Уведомление о выборе инспекции по форме N 1-6-Учет подавайте вместе с сообщением о создании ОП.

ИФНС направит вам уведомление о постановке на учет по месту нахождения ОП, где будет указан его КПП (п. 2 ст. 84 НК РФ).

За опоздание с сообщением о создании ОП организацию оштрафуют на 200 руб. (п. 1 ст. 126 НК РФ, Письмо Минфина от 17.04.2013 N 03-02-07/1/12946).